Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rnaseh2cQ9CQ18 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnaseh2cQ9CQ18 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms