Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Commd4Q9CQ02 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Commd4Q9CQ02 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms