Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc198Q9CPZ1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms