Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg3Q9CPX6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg3Q9CPX6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms