Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Bcl11bQ99PV8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms