Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12aQ99PQ1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12aQ99PQ1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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