Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rtn4rQ99PI8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rtn4rQ99PI8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rtn4rQ99PI8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtn4rQ99PI8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rtn4rQ99PI8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rtn4rQ99PI8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rtn4rQ99PI8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtn4rQ99PI8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms