Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rtn4Q99P72 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rtn4Q99P72 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms