Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll1Q99NC0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll1Q99NC0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms