Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcgf6Q99NA9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcgf6Q99NA9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcgf6Q99NA9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcgf6Q99NA9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcgf6Q99NA9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcgf6Q99NA9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcgf6Q99NA9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcgf6Q99NA9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcgf6Q99NA9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcgf6Q99NA9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcgf6Q99NA9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcgf6Q99NA9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcgf6Q99NA9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcgf6Q99NA9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcgf6Q99NA9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcgf6Q99NA9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcgf6Q99NA9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms