Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atoh8Q99NA2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atoh8Q99NA2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms