Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a6dQ99N07 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6dQ99N07 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ms4a6dQ99N07 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ms4a6dQ99N07 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ms4a6dQ99N07 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ms4a6dQ99N07 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ms4a6dQ99N07 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ms4a6dQ99N07 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ms4a6dQ99N07 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ms4a6dQ99N07 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ms4a6dQ99N07 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ms4a6dQ99N07 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ms4a6dQ99N07 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ms4a6dQ99N07 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ms4a6dQ99N07 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms