Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SrrtQ99MR6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SrrtQ99MR6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms