Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PccbQ99MN9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms