Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbc3Q99ML1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbc3Q99ML1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms