Protein–RNA interactions for Protein: Q99MK9

Rassf1, Ras association domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf1Q99MK9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rassf1Q99MK9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rassf1Q99MK9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms