Protein–RNA interactions for Protein: Q99M73

Krt84, Keratin, type II cuticular Hb4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt84Q99M73 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt84Q99M73 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt84Q99M73 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Krt84Q99M73 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt84Q99M73 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt84Q99M73 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt84Q99M73 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms