Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnps1Q99M28 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnps1Q99M28 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms