Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RtcbQ99LF4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RtcbQ99LF4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms