Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcf2Q99LE6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcf2Q99LE6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms