Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nmd3Q99L48 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms