Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TriobpQ99KW3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TriobpQ99KW3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TriobpQ99KW3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms