Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab28Q99KL7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab28Q99KL7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms