Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Reep3Q99KK1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep3Q99KK1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms