Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Higd1bQ99JY6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms