Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lims1Q99JW4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lims1Q99JW4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms