Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csmd1Q923L3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csmd1Q923L3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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