Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh3bp4Q921I6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sh3bp4Q921I6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms