Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SncbQ91ZZ3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SncbQ91ZZ3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms