Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarca5Q91ZW3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarca5Q91ZW3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms