Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Grin3bQ91ZU9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Grin3bQ91ZU9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms