Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chrna2Q91X60 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chrna2Q91X60 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms