Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU6

Dcaf11, DDB1- and CUL4-associated factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf11Q91VU6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dcaf11Q91VU6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dcaf11Q91VU6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dcaf11Q91VU6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Dcaf11Q91VU6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dcaf11Q91VU6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dcaf11Q91VU6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dcaf11Q91VU6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dcaf11Q91VU6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dcaf11Q91VU6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms