Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cacng5Q8VHW4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cacng5Q8VHW4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms