Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cabp4Q8VHC5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cabp4Q8VHC5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.2 ms