Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd2Q8VEK2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rhbdd2Q8VEK2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rhbdd2Q8VEK2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rhbdd2Q8VEK2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms