Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RfxapQ8VCG9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RfxapQ8VCG9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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