Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GcaQ8VC88 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GcaQ8VC88 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GcaQ8VC88 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GcaQ8VC88 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GcaQ8VC88 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GcaQ8VC88 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GcaQ8VC88 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GcaQ8VC88 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GcaQ8VC88 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GcaQ8VC88 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GcaQ8VC88 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GcaQ8VC88 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GcaQ8VC88 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GcaQ8VC88 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GcaQ8VC88 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GcaQ8VC88 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms