Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ApobrQ8VBT6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ApobrQ8VBT6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ApobrQ8VBT6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms