Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc58Q8R3Q6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms