Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ClmpQ8R373 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ClmpQ8R373 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ClmpQ8R373 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ClmpQ8R373 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ClmpQ8R373 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ClmpQ8R373 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ClmpQ8R373 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms