Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Vmn1r200Q8R281 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Vmn1r200Q8R281 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r200Q8R281 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Vmn1r200Q8R281 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms