Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sf3b4Q8QZY9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3b4Q8QZY9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms