Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rdh16f2Q8K3M1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rdh16f2Q8K3M1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rdh16f2Q8K3M1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16f2Q8K3M1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16f2Q8K3M1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16f2Q8K3M1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16f2Q8K3M1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16f2Q8K3M1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16f2Q8K3M1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16f2Q8K3M1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16f2Q8K3M1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16f2Q8K3M1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Rdh16f2Q8K3M1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rdh16f2Q8K3M1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rdh16f2Q8K3M1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rdh16f2Q8K3M1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Rdh16f2Q8K3M1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rdh16f2Q8K3M1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Rdh16f2Q8K3M1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Rdh16f2Q8K3M1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Rdh16f2Q8K3M1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Rdh16f2Q8K3M1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Rdh16f2Q8K3M1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Rdh16f2Q8K3M1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Rdh16f2Q8K3M1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Rdh16f2Q8K3M1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Rdh16f2Q8K3M1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Rdh16f2Q8K3M1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Rdh16f2Q8K3M1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdh16f2Q8K3M1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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