Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vrk3Q8K3G5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vrk3Q8K3G5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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