Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ssh3Q8K330 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms