Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nsl1Q8K305 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nsl1Q8K305 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nsl1Q8K305 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms