Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ncapd2Q8K2Z4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ncapd2Q8K2Z4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms