Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl47Q8K2Y7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl47Q8K2Y7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl47Q8K2Y7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl47Q8K2Y7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl47Q8K2Y7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl47Q8K2Y7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl47Q8K2Y7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl47Q8K2Y7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl47Q8K2Y7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl47Q8K2Y7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl47Q8K2Y7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl47Q8K2Y7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mrpl47Q8K2Y7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mrpl47Q8K2Y7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl47Q8K2Y7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl47Q8K2Y7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl47Q8K2Y7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl47Q8K2Y7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl47Q8K2Y7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms