Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Shtn1Q8K2Q9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Shtn1Q8K2Q9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms